Плоды и семена (Fructus et Semina) собирают, учитывая их назначение — для использования свежими, сушеными, для промышленной переработки или размножения. Делают это в течение всего дня при прохладной и сухой погоде, однако ликоподий (колоски) лучше и удобнее заготавливать при сырой погоде. В жаркие дни сбор следует производить ранним утром, после высыхания росы, или вечером — до ее появления. Чтобы избежать потерь легко осыпающихся плодов зонтичных растений, собирать их надо рано утром (до схода росы) или в сырую погоду. Заготовляют плоды преимущественно вручную, без плодоножек, одновременно отбрасывая испорченные, помятые, поврежденные насекомыми и плесневыми грибами, а также разные примеси. Совершенно недопустимо и вредно для растений применение так называемой малой механизации при сборе лесных я болотных ягод — черники, брусники, клюквы. С использованием этого варварского метода надо вести борьбу, особенно лесной охране. Мясистые плоды собирают в фазе полного созревания, а те, которые сохраняются на растениях более длительное время, можно заготовлять и позже, — уменьшится их влажность и облегчится процесс сушки. Плоды шиповника целесообразно собирать за несколько дней до полного созревания, когда они еще не приобрели характерной окраски (в это время в них содержится наибольшее количество витамина С).
Корни и корневища (Radix et Rhizoma) большинства лекарственных трав рекомендуется выкапывать по окончании вегетационного периода, — надземная часть растений к этому времени высыхает. Их можно заготовлять также ранней весной и даже на протяжении всего вегетационного периода. Однако в последнем случае содержание действующих начал в корнях ниже, в связи с тем что растение затрачивает питательные вещества на образование листьев и других надземных органов. Крахмал и другие ценные вещества концентрируются, как правило, в корнях и корневищах и накапливаются в большом количестве к осени; содержание в них эфирных масел, наоборот, наиболее высокое в период цветения растений. Тем не менее осенние сборы предпочтительнее по следующим причинам: во-первых, осенью подземные органы растения достигают максимальной массы; во-вторых, обеспечивается естественное возобновление зарослей в результате опадения созревших; и высохших семян. Но при этом нельзя забывать, что осенью часто не удается опознать то растение, корни которого нужно выкопать. По высохшему стеблю нелегко, а подчас невозможно найти искомый «клад». Поэтому корни некоторых лекарственных растений лучше выкапывать весной, например корневища девясила. Корни однолетних растений заготовляют до наступления фазы цветения, а двулетних — в конце первого вегетационного периода. Если корни выкапывать поздней осенью, то желательно в сухую погоду и когда нет заморозков.