В народной медицине ликоподий применяется довольно широко — наружно и внутрь (отвары). Он считается лучшей детской присыпкой. Наружно его водный отвар используется для ванн, обмываний и примочек при кожных заболеваниях — зудящих сыпях, чешуйчатом лишае, чесотке, фурункулах и гнойниках. Он пригоден также для местных ванн при судорогах. В Калининской области споры плауна варят или топят с воском в растительном (лучше льняном) масле и в виде мази прикладывают к нарывам и язвам. Отвар ликоподия пьют при болях в мочевом пузыре, остром его воспалении и спазмах, а также при камнях в почках. Для этого берут 2 столовые ложки спор, заливают 2 стаканами сырой воды и кипятят 15 мин, помешивая ложкой. Затем отвар остужают и пьют небольшими глотками. Если под рукой нет ликоподия, то принимают подобный отвар из веток плауна (30—40 г на 1 л воды). Для лечения почек веточки плауна смешивают с другими мочегонными травами (зверобой, ромашка и др.). Кроме того, ликоподий используют от запоров, колтуна — специфической экземы на покрытой волосами части головы (откуда и его народное название «колтунник»), при бессоннице, задержке выделения мочи и от «волосатика» (костоеда). Спорами присыпают раны, обмороженные и опрелые места, ожоги. В Польше траву употребляют наружно и внутрь от колтуна. Ликоподий очень широко применяется в гомеопатии при лечении болезней желудочно-кишечного тракта и печени, а также при хронических заболеваниях дыхательных органов (пневмонии, бронхите и др.).
Так как споры плауна легко воспламеняются, то порошок ликоподия часто употребляли раньше в театрах для создания световых эффектов; его применяли в пиротехнике, а также в металлургической промышленности при фасонном литье и формовке металла. Сухие листочки плауна способны окрашивать ткани в зеленый цвет. В некоторых районах Северо-Запада и Прибалтики плети плауна используют как банные мочалки. Не прилагая больших усилий, такими лесными мочалками можно легко растереть тело докрасна. Не потому ли народ и дал такие клички плауну, как дерняк, дерябка, дерюга. Трава плауна булавовидного очень популярна в народе. В Вологодской области до сих пор сохранилось поверье, что если ее держать в доме, то будет ссора, откуда и народное прозвание травы — деряга-ссорница. В Норвегии этой травой, применив особую протраву, красят ткани, в том числе и шерстяные, в синий цвет, а из длинных плетей плауна делают половики. Ликоподий имеет большой спрос на мировом рынке и служит ценным экспортным товаром.