Чистотел известен в медицине, особенно народной, издавна. В прошлом веке некоторые врачи пропагандировали его как эффективное противораковое средство, но научного обоснования этому не было. Сейчас же это доказано клиническими исследованиями. Выявлено, что трава чистотела задерживает рост злокачественных опухолей, особенно наружных — на коже, губе и т. д. В народной медицине трава чистотела давно славится как-средство от бородавок, мозолей, веснушек, язв, для заживления ран. Ее используют при болезнях печени и желчных путей, экземе, подагре и эпилепсии. Сок и настойку растения употребляют при полипах, а препаратами из свежей травы лечат экзему и волчанку. Отвар травы и корней пьют при ревматизме, гипертонии, дизентерии. Свежую траву иногда прикладывают к телу при чесотке. Мозоли и бородавки выводят свежим млечным соком чистотела. Из отвара корней и травы делают ванны, примочки, им также обмываются при заболеваниях кожи (сыпях, лишаях, угрях), диатезе и гнойных ранах. Долго не заживающие язвы обрабатывают порошком из листьев или прикладывают к ним свежие измельченные листья. Сок или мазь из свежих листьев применяют при туберкулезе кожи. В некоторых районах Сибири сок чистотела употребляют вместо иода.
Наблюдения некоторых врачей свидетельствуют о хорошем действии растения при грудной жабе, бронхиальной астме и хроническом полиартрите. Корень чистотела входит в состав препаратов, назначаемых при желчнокаменной болезни, рецидивах гепатита, холецистите. Установлено также мочегонное, болеутоляющее, слабительное и спазмолитическое действие травы чистотела. Она является официальным лекарственным сырьем в нашей стране, США, ГДР, ФРГ, применяется и в других странах. В Болгарии эффективно используется млечный сок чистотела при болезнях печени и желчного пузыря. При лечении заболеваний желудочно-кишечного тракта, геморроя и женских болезней растение применяют в Польше. Во Франции его считают хорошим возбуждающим, мочегонным и слабительным средством, а соком, как и у нас, выводят бородавки. В немецкой народной медицине отвар травы и корней используют при камнях в печени, подагре, заболевании селезенки, катаре желудка и кишечника, гриппе, ревматизме и геморрое. В гомеопатии чистотел — незаменимое средство при болезнях печени и желчных протоков. В тибетской медицине его цветки считаются жаропонижающим средством. Внутреннее применение чистотела требует большой осторожности и обязательного врачебного контроля
Порошок из сухой травы растения можно использовать для борьбы с насекомыми — вредителями огородов, садов и полей путем опыления им или окуривания. В технике трава чистотела известна тем, что предупреждает коррозию некоторых металлов.